元信生物
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转录组研究


RNA测序:研究特定组织或细胞在某一功能状态下所能转录出来的所有RNA(包括mRNA和非编码RNA)的类型与拷贝数,实现样品间差异基因的挖掘,聚类和表达谱分析等。

 Small RNA测序:Small RNA(sRNA,主要包含microRNAs、siRNAs和 pi RNAs)是生命活动重要的调控因子,主要通过miRNA与靶mRNA特异性结合调控靶mRNA的表达,从而参与许多生命过程,如细胞增殖、 细胞凋亡、脂肪代谢和细胞分化等。Illumina能够对细胞或者组织中的全部Small RNA进行深度测序及定量分析等研究。实验时首先将18-30 nt范围的Small RNA从总RNA中分离出来,两端分别加上特定接头后体外反转录做成cDNA再做进一步处理后,利用测序仪对DNA片段进行单向末端直接测序。通过Illumina对Small RNA大规模测序分析,可以从中获得物种全基因组水平的miRNA图谱,实现包括新miRNA分子的挖掘,其作用靶基因的预测和鉴定、样品间差异表达分析、miRNAs聚类和表达谱分析等科学应用。

 LncRNA测序:长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)是一类转录本长度超过200nt、不编码蛋白的RNA。利用新一代高通量测序技术进行lncRNA测序,并结合生物信息学的预测工具进行lncRNA分析,有助于科研工作者更快发现那些具有重要调控功能的lncRNA,分析其与特定生物学过程的关系。